Zastosowanie metody MALDI-TOF do identyfikacji szczepów Clostridium perfringens
[Application of the MALDI-TOF for identification of Clostridium perfringens strains]

STRESZCZENIE

Beztlenowe laseczki Clostridium perfringens powszechnie występują w glebie i ściekach, a także wchodzą w skład naturalnej bioty przewodu pokarmowego ludzi i zwierząt. Zatrucia pokarmowe o etiologii C. perfringens należą do jednych z najczęstszych chorób przenoszonych przez skażoną żywność na świecie. W pracy wykorzystano metodę MALDI-TOF do identyfikacji archiwalnych szczepów C. perfringens izolowanych od chorych z objawami zatruć pokarmowych i próbek żywności włącznie z weryfikacją uzyskanych wyników metodą sekwencjonowania 16S rRNA. Potwierdzono przydatność metody MALDI-TOF do identyfikacji gatunkowej szczepów C. perfringens. Uzyskano zgodne wyniki identyfikacji metodą MALDI-TOF, sekwencjonowania 16S rRNA oraz wykrywania obecności genu cpa.

ABSTRACT

Introduction: The anaerobic bacilli Clostridium perfringens are commonly found in soil and sewage and are also part of the gastrointestinal tract of humans and animals. Food poisoning caused by C. perfringens are regarded the most common diseases transmitted by contaminated food in the world. Bacteria of this species due to their pathogenic properties sustain the constant object of studies in order to elucidate mechanisms of toxinogenesis, to determine the roads of transmission and to develop better diagnostic tools. The objective of the study was to verify the suitability of the MALDI-TOF method for the identification of C. perfringens species. Methods: In order to identify anaerobic bacteria C. perfringens MALDI-TOF method, sequencing of 16S rRNA and detection of cpe and cpa gene by duplex PCR were used. Results: MALDI-TOF confirmed C. perfringens identification in 39 isolates out of 41 archival isolates under study. The correctness of the results was verified by 16S rRNA sequencing and cpa gene detection. Conclusions: The study confirmed the usefulness of MALDI-TOF method in rapid identification of anaerobic bacteria C. perfringens and thereby its applicability epidemiological investigations.